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Nivero-uv/Analysis_long_reads

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Analysis_long_reads

Proyecto de Análisis de de tecnologias de secuenciacion de lectura larga

Este repositorio contiene scripts y datos para el análisis de transcriptomas utilizando tecnologías de secuenciación de lectura larga como Iso-Seq y MAS-Seq.

Descripción

La generación de modelos de transcripción con respaldo de lecturas y anotaciones basadas en transcritos con precisión a nivel de nucleótidos y la unificación de anotaciones podría esclarecer hipótesis referentes a los mecanismos del empalme alternativo. Esto evitaría la necesidad de reconstruir transcripciones no incluidas en los modelos de transcripción existentes.

Características del proyecto:

  • Proprocesamiento de las muestras.
  • Análisis comparativo de tecnologías de secuenciación de lectura larga.
  • Deteccion de sesgos.
  • Analisis de transcritos de control.

Flujo de trabajo

method_tmf drawio

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