ParallelComputationExamples

Примеры кодов с MPI, OpenMP и CUDA. Код собран при помощи CMake.

Инструкция по использованию MPI кластера

Компиляция программ происходит при помощи компиляторов mpicc и mpic++. Подключение происходит при помощи команды

module add mpi/openmpi4-x86_64

После этого mpicc и mpic++ подгрузятся в $PATH

Запуск программ MPI

Для локального запуска можно использовать скрипт run_local.sh. Опция -np используется для указания количества процессов.

MPI локально может быть установлен для следующих ОС:

Ubuntu: sudo apt-get install openmpi-bin libopenmpi-dev

Mac OS: brew install open-mpi

Команды по использованию SLURM

• sinfo - посмотреть информацию по нодам кластера
• sinfo -N -l - посмотреть информацию по каждой ноде кластера
• squeue - посмотреть очередь задач
• srun <command> - запустить команду на ноде кластера
• sbatch <script> - запустить скрипт на нодах кластера. Каждый скрипт должен начинаться с #!/bin/bash. Примеры запуска команд можно найти здесь. После этого должно высветиться сообщение Submitted batch job <job_id>, результаты работы попадают в лог-файл slurm-<job_id>.out.

Полезные ссылки:

• https://www.open-mpi.org/doc/current/ - мануал OpenMPI 4.0
• https://mpitutorial.com - хороший tutorial по MPI с примерами.